Erst 1905 – drei Jahre nach Neugründung der Universität (WWU) – entstand eine neue medizinisch-propädeutische Abteilung. Der Bau der ab 1913 geplanten Klinikanlagen kam wegen des Ersten Weltkriegs zum Erliegen; erst im Jahre 1925 konnten die Klinikbauten fertig gestellt und offiziell die Medizinische Fakultät der WWU gegründet werden (Weißgerber 1926). Aufgrund der Zerstörung großer Teile des Klinikums wurde die Medizinische Fakultät während des Zweiten Weltkriegs vorübergehend nach Bad Salzuflen verlagert (MZ, 11.05.2000). Nach der Wiedereröffnung der Medizinischen Fakultät in Münster im November 1945 folgte "eine beispiellose Blütezeit", in der – neben der Beseitigung der Kriegszerstörungen – "etliche Neubauten entstanden und zahlreiche neue Kliniken und Institute gegründet wurden" (ebd.; zur Baugeschichte vgl. im Einzelnen Niemer 2010). Bereits im Jahre 1962 wurde ein internationaler Planungswettbewerb für den Bau eines Großklinikums ausgeschrieben; erst 1971 (nach Verabschiedung des Hochschulbaugesetzes NRW von 1969) konnte mit dem Rohbau begonnen werden. Im Juni 1982 wurde das neue sog. Zentralklinikum offiziell eröffnet.

Durch den gut eine Mrd. DM teuren Neubau des Zentralklinikums (einschl. Zentralgebäude, Versorgungszentrum, Lehrgebäude etc.) wurde das UKM nicht nur zu eine der größten, sondern auch der modernsten Kliniken Deutschlands, obwohl die Architekten (Weber, Brand und Partner), die zur gleichen Zeit auch die Universitätskliniken in Aachen betreuten, in ihrem Entwurf zunächst sogar vier anstelle der zwei errichteten Bettentürme geplant hatten. Aufgrund der hohen Neubaukosten für das Zentralklinikum blieb die Modernisierung des alten Klinikteils zunächst überfällig. Noch nicht einmal 25 Jahre später wurde sogar die Existenz des Zentralklinikums wegen hoher Modernisierungs- bzw. Sanierungs- und Energiekosten in Frage gestellt (Schemann 2005). Anfang 2007 beschloss der Aufsichtsrat des UKM eine grundlegende Modernisierung der Bettentürme und die Errichtung eines größeren Erweiterungsbaus auf dem Gelände der heutigen Parkpaletten unmittelbar nördlich des Zentralklinikums. In diesen Neubau sollen fast alle Kliniken, die bislang in separaten älteren Gebäuden untergebracht sind, als Einrichtungen moderner Hochleis­tungsmedizin untergebracht werden.

Künftig soll die Effizienz des UKM durch Gliederung in neue Zentren weiter verbessert werden (Völker 2007). Diese ehrgeizigen Ziele des UKM-Umbaus werden 2010 durch einen baulichen Masterplan konkretisiert. Bisherige Kostenschätzungen liegen bei bis zu 390 Mio. €. Dem übergeordneten Ziel des Umbauprogramms, nämlich der Zentralisierung und zugleich besseren Vernetzung von Forschung, Lehre und Krankenversorgung, wurde im Frühjahr 2010 – quasi als vorgezogener Beginn des 10-Jahres-Masterplans – mit der Vorbereitung des Ausbaus eines hochmodernen sog. PAN-Zentrums (Zusammenschluss von Pathologie, Anatomie und Neuropathologie) am Vesaliusweg Rechnung ge­tragen. Das UKM mit seiner – auch überregional wirksamen – Spitzenversorgung im Gesundheitswesen profitiert nicht nur von der großen Medizinischen Fakultät der Universität, sondern u. a. auch von den Synergie­effekten mit benachbarten hochmodernen Forschungs- und Entwicklungseinrichtungen, wie z. B. dem 2007 in der Nähe der Hautkinik neu eröffneten Max-Planck-Institut für molekulare Biomedizin.

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